Ecole Thématique DynamoPPI-2018
Le Groupe Graphisme et Modélisation Moléculaire (GGMM), soutenu par le programme PIRAMID, a organisé une école thématique :
"Dynamique et Modulation des Interactions Protéine-Protéine (DynamoPPI – 2018)" qui a eu lieu à Nantes du 28 mai au 1er juin 2018.
Cette école thématique a permis de vous initier ou d'approfondir vos connaissances en modélisation des interactions protéine-protéine. Une attention particulière a été portée à la complémentarité des méthodes expérimentales et théoriques. Les méthodes abordées durant cette école ont couvert notamment l'amarrage macromoléculaire, les simulations multi-échelle, les calculs d'énergie libre, et ont été présentées en sessions théoriques et accompagnées d'ateliers pratiques.
La formation était ouverte aux étudiants en thèse, aux post-doctorants et aux chercheurs intéressés par l'étude des interactions protéine-protéine par des approches biophysiques et bioinformatiques. Le nombre de places étant limité à 20 participants, une pré-inscription sur le site de l'école thématique était requise : https://dynamoppi.sciencesconf.org
Les grandes lignes du programme ont été :
- Maîtrise des bases de données de référence pour les interactions protéine-protéine
- Simulations multi-échelle (dynamique moléculaire, modes normaux, QM/MM)
- Prédiction d'interactions protéine-protéine
- Criblage virtuel et calculs d'énergie libre
- Visualisation moléculaire
Les intervenants présents étaient :
* Alexandre Bonvin, Utrecht, Pays Bas (http://www.bonvinlab.org)
* Jacqueline Cherfils, ENS Cachan, Paris-Saclay, France (http://lbpa.ens-paris-saclay.fr/)
* Christophe Chipot, Univ. Nancy, France – Univ. Illinois, USA (http://www.srsmc.univ-lorraine.fr/spip3011/?Chipot-Christophe)
* François Dehez, Univ. Nancy, France (http://www.edam.uhp-nancy.fr/index.php/persodehez-22042)
* Christian Ottmann, Univ. Eindhoven, Pays-Bas (dr. C. (Christian) Ottmann – Expertise)
* Didier Rognan, Univ. Strasbourg, France (http://www.edam.uhp-nancy.fr/index.php/persodehez-22042)